上疏永曆帝，表示說：“恩威不出陛下而出旁門，小人濫進，貨賄公行……社稷存亡之大，此非小事，臣不敢不言。”
馬吉翔見此疏，深恨李成棟。不久，李成棟集結兵馬準備北上南雄進入江西抗清。他臨行前，想入肇慶與永曆帝辭別。
馬吉翔聞訊，連忙於宮中造謠，說李成棟想仿效董卓和朱溫，要趁入見時解散皇帝親兵，以他的舊部替代，把皇上當傀儡。
由於李成棟昔日瘋狂屠殺明軍的表現仍歷歷在目，永曆帝不能不疑。他派遣鴻臚卿吳侯去安撫李成棟，告訴他不必面君。
李成棟一片赤誠，對此一無所知，直到他見到在朝中任官的義子李元胤，才知道自己被馬吉翔冤枉的實情。為此，他嘆息說：“我初歸附國家，詣闕面君是正常的禮節。此次出行，誓死嶺北！我只想與皇上辭別，交付公卿大臣後事，不想小人輩洶洶如此，恨吾不能剖心示誠！可嘆的是，我坐受無君之謗，徒以血肉付嶺表耳！”
行至三水，永曆使臣馳至，仍敕其不得入朝。李成棟望闕大慟，就地拜辭。然後，他從清遠順流而去。臨行之時，他長嘆道：“吾不及更下此峽矣！”
清軍方面，在中原聚集滿、蒙、漢大軍數萬人，一支軍由孔有德、濟爾哈朗指揮，逼向湖廣；另一支軍由譚泰、尚可喜、耿仲明率領，直撲江西南昌。
金聲桓、王得仁起事後，得知隆武帝遇難訊息，就趕忙和得立的永曆帝聯絡上，表示尊奉。如果他們在佔領九江後馬上奇襲南京，攻取安徽和江蘇，會使長江中下游地區的反清大局發生極大的有利變化。不料，軍事會議中，有人認為贛州有清將高進庫在那裡，一定要首先拔除。由此，沒有遠略的金
