清軍入閩前也被鄭芝龍調走。當時，只有鉛山縣義勇數百人小規模進行武裝抵抗，分山關很快為清軍所攻下，沒費氣力。
特別令人痛心的是，閩北重鎮建寧（今建甌）城堅人眾，糧多地險，清軍初至，守城明朝官員竟不戰而降。而作為延平府的南平，鄭芝龍一道命令，守軍棄城而去，形同虛設。
正是由於南平的忽然失陷，人在汀州的隆武帝猝不及防，終被清軍擒斬。
而後，清軍急行軍，不到一個月，就在當地漢人大地主黃氏一家導引下進入福州，這樣，清軍基本上是不戰而得福建省會。
在福州，明朝的禮部尚書曹學恮自縊殉國。曾任崇禎朝大學士的傅冠本想躲到自己的學生泰寧縣江亨龍家裡避難，最終卻被江氏父子告發，清軍派人來抓捕。傅大學士聞訊，想自殺殉國，被江亨龍之子江忠源親率家奴捆綁，一路拳打腳踢，把這位江氏父子的恩人送入李成棟軍營去報功。
李成棟見前朝大學士，非常尊敬，便勸他投降。“傅公，您乃國家大臣也，只要您遵制剃髮，您一定會得大清重用。”
傅冠詫嘆地問：“自中華有冠裳以來，難道有髡頭宰相嗎？”
李成棟復勸：“傅公您華髮已稀，與髡何異！只要稍稍在頭上加塊布包頭，以掩眾目，我就可交差，報聞說您已經遵制剃髮。”
傅冠厲聲說：“你知道傳誦千古的文天祥嗎？那是我老鄉啊。吾鄉無髡頭宰相，但有斷頭宰相耳！”
他作詩一首，表達自己的忠貞意念：“憤血已成空，往事徒回首；國難與家仇，永訣一杯酒。幻影落紅塵，倏忽成今古；名望重如山，此身棄如土！”
李成棟自此不再勸降，禮待甚厚。
後來，李成棟既率兵入廣，汀州留守鎮將李發待傅大學士如初。一日，二人對弈。局罷，李發接到一封文書，忽然下拜說：“傅公如果再不剃
