有地方可工作了。我對這一點了解得十分清楚。我惟一要操心的是——孩子們怎麼辦，怎麼來保證她們的未來……”
1991年12月26日，蘇聯最高蘇維埃共和國院舉行了最後一次會議，透過了一項宣言，從法律上宣佈終止蘇聯的存在，宣言稱“這不是一個喜劇，而是一個悲劇，實際上是一個偉大國家的結束”。從此，蘇聯成為歷史。
據俄國報紙透露，在蘇聯解體之前，普京就退出了蘇共，但是沒有透露具體時間。有專家推測，那應該是在1991年7月和12月之間，即葉利欽和索布恰克退出蘇共和蘇聯正式解體之前。
1992年初，尚未滿40歲的普京，被任命為聖彼得堡市副市長。翌年他又兼任市政府的日常事務委員會主席。1994年，普京出任聖彼得堡第一副市長，仍然兼任對外聯絡委員會和日常事務委員會主席，在聖彼得堡可說是權力僅在索布恰克一人之下。這種現象引起了俄國新聞界的興趣。當時有記者問索布恰克：“您為什麼要重用一個克格勃？”索布恰克的回答是：“他不是克格勃，他是我的學生。”
索布恰克是市長，但是他對這些具體的工作沒有興趣，他經常外出訪問，周遊列國，或到莫斯科和俄國其它地方出席會議。因此普京不僅主管對外經濟工作，逐漸也負責起市政府的日常工作。他勇於任事，效率高，姿態低而又不居功，因此深得索布恰克的信任和喜愛。索布恰克本人性格多疑，從一個法學教授成為市長以後，角色的急劇轉變使他在官場遇到各種各樣的人和事，圍著他的人們不外乎要官、要好處，使他更加防備。但他惟獨對普京十分信任，普京決定的事情，索布恰克就批准。不過普京從不越權，凡是他職權範圍內可以決定的事情，他做了決定之後，都會呈報索布恰克，並且對申請者說明“此事還要同市長商量”。因此在索布恰克外出期間，市長一般由普京代理。 。。
普京擔任聖彼得堡副市長和第一副市長期間，全力推動該市引進外資、外商和設立聖彼得堡自由經濟區。他領導有關部門建立了外匯交易所，以方便外商、遊客和市民兌換外幣。普京批准了著名的顧問公司KPMG在聖彼得堡設立分公司，使外國投資者可以透過這個顧問公司瞭解在聖彼得堡投資的各種具體問題。在吸引外資方面，普京的工作重點是德國和北歐公司。實際上，德國和北歐公司在歷史上就是聖彼得堡的主要外資來源。德累斯頓銀行財團就是在普京的勸說下決定在聖彼得堡投資的。
因此，在聖彼得堡工作，使普京不僅和索布恰克建立了緊密合作的關係，更重要的是積累了管理經濟和政府以及處理外交事務的經驗，所以他後來能夠很快在莫斯科開啟局面。普京還由於擔任這個職務，和俄國正在崛起的青年一代政治精英之一的丘拜斯（當時擔任索布恰克的經濟顧問）建立了聯絡。
普京在聖彼得堡工作的六年非常重要。他過去一直服役於克格勃，從來沒有做過行政方面的工作，沒有管理經濟的經驗。他習慣於在隱蔽戰線，以雙重（合法的和偽裝的）身份和別人打交道，特別是在德國主要是和外國人打交道，對國內的事務並不熟悉。從德國回國後，普京在聖彼得堡經歷了蘇聯解體、蘇共解散等驚心動魄的變化，經歷並且參與了由蘇聯的極權和計劃經濟體制向民主政治和市場經濟的轉變，又領導了聖彼得堡的市政府，從而積累了可貴的政治、行政和管理經驗，包括和媒體打交道的經驗。這對普京後來到莫斯科工作都是很有益的。任何政治首先都是地方的政治，有否在一個城市或一個地區擔任行政首長的經歷，是大不相同的。
重回“克格勃”
1996年的聖彼得堡市長選舉，索布恰克躊躇滿志，全力以赴，準備連任。他的對手是他原來的副手弗拉基米爾·雅科夫列夫。索布恰克在聖彼得堡執政六年，樹敵甚多，政績卻不明顯。聖彼得堡市民需要的是更實在的東西。雖然普京擔任了索布恰克競選總部的負責人，但是索布恰克造成的局面，普京也無能為力，何況他並不是競選方面的專家。
這時候，普京已經脫離了克格勃。他的辭職很有傳奇色彩。當他剛剛到索布恰克那裡工作的時候，也曾經猶豫是否離開他為之奮鬥了15年，而且頗有建樹的克格勃。這是他一生中最艱難的決定。他思考了很長時間，最後還是提筆寫下辭職書。為了防止訛詐，他決定公開宣佈他在克格勃工作過。他找到了他的一位朋友、電影導演沙德克罕，秘密錄製了一段專訪紀錄片，詳細地介紹了他是如何在克格勃工作的、什麼時間做過什麼等等。並在列寧格勒電
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